一(yī)、人源/小(xiǎo)鼠細胞STR鑒定背景介紹
細胞系作爲正常或腫瘤組織的模式細胞被廣泛應用于科學研究和藥物(wù)開(kāi)發,然而很大(dà)一(yī)部分(fēn)的細胞系被錯誤标記或被其它個體(tǐ)、組織、種系來源的細胞所替代,由于科學界無法解決此類問題以緻大(dà)量因使用錯誤鑒定的細胞系而導緻誤導或存在潛在錯誤的學術論文發表。
大(dà)部分(fēn)的細胞系在學術環境中(zhōng)被建立,在學術環境下(xià),組織培養通常被認爲是一(yī)種對技能少有要求的技術,其所用到的必要設備如流動櫃和孵育箱使用起來沒什麽限制。在這些情況下(xià),嘗試建立一(yī)種新的細胞系通常會導緻交叉污染是不足爲怪的。
有許多緣由可以引起細胞培養物(wù)錯誤鑒定,每一(yī)個實驗室都存在風險。或許細胞錯誤鑒定最直接的原因就是在常規操作過程中(zhōng)對細胞培養容器進行了錯誤标記。造成這種問題出現的原因有:實驗員(yuán)的工(gōng)作負荷、缺乏注意以及在細胞操作過程中(zhōng)的分(fēn)心。
培養物(wù)的交叉污染以及随後污染細胞的過量生(shēng)長是另一(yī)個引起細胞系錯誤鑒定的常見原因。這種情況發生(shēng)的幾率在以下(xià)條件會增加:試劑的共用、操作時反複使用相同的未經徹底消毒和清場的工(gōng)具及設備、在沒有充分(fēn)分(fēn)離(lí)每一(yī)細胞類型情況下(xià)同時對多個培養物(wù)進行操作。當交叉污染發生(shēng)時,一(yī)種細胞類型迅速生(shēng)長而超過另一(yī)種,在4-5次細胞傳代後,一(yī)個純的污染細胞培養物(wù)将會形成。
在使用其它物(wù)種的滋養層(例如小(xiǎo)鼠3T3細胞)來繁殖人類幹細胞或原始細胞時有意地共培養會導緻交叉污染或人類細胞系過生(shēng)長。正常情況下(xià),滋養層細胞處于無增殖狀态,但隻要生(shēng)長抑制程序不完全,它就會不斷繁殖并逐步取代人類細胞。體(tǐ)細胞雜(zá)交雖不常見但也會發生(shēng),如人類套細胞淋巴瘤細胞系NCEB-1就攜帶了小(xiǎo)鼠的七條染色體(tǐ)。
異種移植也會導緻細胞系交叉污染和錯誤鑒定,來自異種移植的複蘇細胞會被宿主動物(wù)細胞所替代。
一(yī)般而言,交叉污染最終的結果将會是少量适應細胞完全且快速的替代。兩個細胞系不能持續共存于同一(yī)個培養環境,除非它們是共生(shēng)關系,但這種情況據我(wǒ)(wǒ)們所知(zhī)還未有報道。一(yī)個細胞群經過許多次傳代後還能包含一(yī)個穩定的混合基因組,唯一(yī)已知(zhī)的情況是體(tǐ)細胞雜(zá)交。
簡單、經濟的質控措施能夠阻止或至少會減少細胞錯誤鑒定的發生(shēng)。由于缺乏重視及未采用質控措施導緻細胞錯誤鑒定現象極其普遍。
通過對細胞錯誤識别和交叉污染長達50年的追蹤和研究,STR分(fēn)型方法已成爲對人源細胞和小(xiǎo)鼠細胞進行鑒定的标準方法,STR分(fēn)型的應用也成爲根除細胞錯誤鑒定這一(yī)問題的關鍵質控手段。
二、CELL STR ID®STR分(fēn)型檢測原理。
我(wǒ)(wǒ)公司CELL STR ID®STR分(fēn)型檢測體(tǐ)系,通過對人源和小(xiǎo)鼠細胞具有高度多态性的STR标記進行基因分(fēn)型分(fēn)析。特定的細胞系具有獨特的STR分(fēn)型數據,通過對待檢細胞樣本的STR分(fēn)型進行檢測,得到的STR分(fēn)型數據與數據庫标準細胞的STR數據進行盲比,根據匹配度高低,确認待檢細胞樣本的真實身份。通過對待檢樣本的背景信息及STR分(fēn)型圖譜進行綜合分(fēn)析,判斷待檢樣本是否交叉污染。通過對不同代次的細胞STR數據進行分(fēn)析,評估細胞的傳代穩定性。
三、CELL STR ID®人源/小(xiǎo)鼠細胞STR鑒定委托檢測流程
3.1 電(diàn)話(huà)或咨詢确認相關信息(價格、樣本要求、周期、付款及合同)
3.2 送樣檢測,填寫電(diàn)子訂單發送至:hkgene@126.com
3.3 檢測分(fēn)析、報告整理、結果發送。
四、人源/小(xiǎo)鼠細胞STR分(fēn)型檢測圖譜及參考文獻
參考文獻:
4.1、 Capes-Davis, A., Theodosopoulos, G., Atkin, I., et al. (2010) Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines. Int. J. Cancer 127 (1), 1−8
4.2、Cell Lines as Biological Models: Practical Steps for More Reliable Research
4.3、Cases of Mistaken Identity 2007
4.4、ATCC SDO Workgroup ASN-0002 (2010) Cell line misidentification: the beginning of the end.
五、公司項目優勢:
5.1 快速(送我(wǒ)(wǒ)們檢:4-5個工(gōng)作日,客戶自檢3-5h).
5.2 可比對人源細胞STR數據8000+,小(xiǎo)鼠細胞STR數據77個
5.2 人源、小(xiǎo)鼠都可以做STR鑒定,遇到非人源細胞還可以通過我(wǒ)(wǒ)們的種屬鑒定體(tǐ)系确認種屬(包括人、小(xiǎo)鼠、大(dà)鼠、倉鼠、非洲綠猴、豬、狗、牛、羊等10個種屬)
5.3 提供配套自檢方案(儀器、試劑、軟件、技術培訓),便于用戶實現自主可控監測。同一(yī)套儀器可實現人源/小(xiǎo)鼠細胞STR鑒定、種屬鑒定、菌種鑒定、端粒酶檢測、HLA分(fēn)型、宿主細胞DNA片段殘留及片段大(dà)小(xiǎo)分(fēn)析等。
5.4 提供STR鑒定的其它質控意義數據及相關知(zhī)識分(fēn)享,STR鑒定技術培訓