人類細胞20個基因座檢測
目前基因座最多的檢測服務,所選用的基因座不僅包含ATCC和JCRB細胞庫中(zhōng)的基因座,更添加11個高度多态性位點,可方便與權威數據庫進行比對,具有極高的準确性。位點如下(xià):
比對數據庫:ATCC、DSMZ、JCRB、COG、ECACC、KCLB、ICLC...
備注:
1.根據 ANSI 制定的國際标準,細胞系的匹配度≥80% 時,認爲它們具有相關性,即衍生(shēng)于共同的祖先細胞;匹配度在 55% 至 80% 之間,需要進一(yī)步驗證相關性;小(xiǎo)于 55%,表明兩者不具有相關性。
2.有效峰爲真實的PCR 條帶;小(xiǎo)峰和非特異性條帶在計算中(zhōng)忽略不計。
3.本匹配度計算默認依照 ATCC 的計算規則,少數情況時依照 DSMZ 的計算規則,若有個性化需求委托方可提前提出。
4.委托方細胞樣本若爲幹細胞,免疫細胞,原代細胞等細胞,且未提交至公開(kāi)數據庫,STR 數據與數據庫比對無意義。
5.STR 數據比對默認 ATCC,DSMZ,JCRB 等細胞庫,也可比對 ECACC,COG,CBA,KCLB 等數據庫或文獻,需提前注明被檢樣本的比對來源。
送樣要求:用戶提供DNA或細胞 樣本,加冰袋運輸;同時請注明細胞數量或DNA含量,DNA 含量最好大(dà)于50ng/μl,體(tǐ)積大(dà)于20μl。如提供細胞,請提供PBS細胞懸浮液,離(lí)心沉澱,去(qù)上清液,可常溫特快專遞運輸(京外(wài)客戶推薦方法);細胞數量≥1000000個。
STR背景知(zhī)識
STR基因座是短的重複序列,核心序列爲2-6個堿基重複單位,廣泛分(fēn)布在人類基因組中(zhōng),約占整個基因組的3%,具有高度多态性,其多态性主要源自核心序列重複次數在個體(tǐ)間的差異,因此利用STR可以有效進行個體(tǐ)識别和細胞鑒定。[8,9]
通過在STR序列側翼設計特異性引物(wù),可以用PCR方法将STR序列擴增出來。我(wǒ)(wǒ)們在引物(wù)末端标記熒光基團,得到的PCR産物(wù)帶有熒光信号,毛細管電(diàn)泳過程中(zhōng)可以被激光器探測到并識别。采集到的熒光信号經過分(fēn)析比對,轉換爲基因型數據。
科研成果能夠得到重複确認,對于證實科學發現是十分(fēn)重要的。如果數據無法重複,那麽這個結果能否得到業界的認可并爲研究人員(yuán)所追随就是個很大(dà)的疑問了。很多生(shēng)物(wù)醫藥的研究都采用培養細胞來進行,這些細胞可能是從各大(dà)細胞庫得來,也可能是受贈于其它研究人員(yuán)。據估計,15-20%的時間裏,實驗中(zhōng)所使用的細胞已經不是原來的細胞系,或者與其它細胞系發生(shēng)了交叉污染。
我(wǒ)(wǒ)們提供的服務
STR數目
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熒光标記種類
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遺傳信息量
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基因座兼容性
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16
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4
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+++
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ATCC STR database+CODIS
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20
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5
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+++++
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以上全部 + 4個高度多态性位點
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16個基因座檢測服務,完全包含9位點系統另外(wài)增加7個高度多态性基因座,具有更多遺傳信息和更高準确性
20個基因座檢測服務,是目前世界上基因座較多的檢測服務,兼容以上各組數據之外(wài)更添加4個高度多态性位點,滿足低污染率的高準确性要求。
高度豐富信息:同時分(fēn)析多個STR基因座,可以準确的判斷交叉污染和細胞類型。
高度靈敏:可以檢測最低0.1ngDNA(約15個二倍體(tǐ)基因組),微量樣本即可滿足需求,并且可以檢測到早期污染。
高通量和系統化平台:采用自動化分(fēn)析系統可大(dà)量檢測及數據分(fēn)析,結果更加準确、客觀。