細胞STR分(fēn)型介紹
短串聯重複序列(shorttandemrepeat,STR)是核心序列爲2-6個堿基的短串聯重複結構。20世紀90年代初,STR基因座首次作爲一(yī)種重要的遺傳标記在人類親權鑒定中(zhōng)被使用(Edwardsetal.,1992;Edwardsetal.1991)。
細胞STR分(fēn)型(celllineSTRgenotyping),是選用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個具有高度多态性基因座和一(yī)個性别基因位點Amelogenin對人源細胞進行STR分(fēn)型檢測。根據STR分(fēn)型結果對細胞的生(shēng)長狀态(是否存在交叉污染)和細胞的株系進行确認的技術手段。
細胞STR分(fēn)型的意義
科研成果能夠得到重複确認,對于證實科學發現是十分(fēn)重要的。如果數據無法重複,那麽這個結果能否得到業界的認可并爲人所追随就是個很大(dà)的疑問了。很多生(shēng)物(wù)醫藥的研究都采用培養細胞來進行,這些細胞可能是從各大(dà)細胞庫得來,也可能是受贈于其它研究人員(yuán)。據估計,15-20%的時間裏,實驗中(zhōng)所使用的細胞已經不是原來的細胞系,或者與其它細胞系發生(shēng)了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它細胞庫(CoriellInstituteforMedicalResearch,EuropeanCollectionofCellCultures(ECACC),DeutscheSammlungvonMikrorganismenandZellkulturen(DSMZ),JapaneseCollectionofResearchResources)都收到過提交的“錯誤”的細胞系,盡管提交者把細胞系提交到上述機構之前,還經過了檢驗。然而,最終證實這些細胞系還是鑒别錯了(4,5)。此外(wài),幹細胞也可能被污染,作爲幹細胞賴以增殖的哺育細胞層,小(xiǎo)鼠細胞很容易污染到幹細胞中(zhōng)。顯然,細胞系遭到污染、特征鑒别錯誤,将會極大(dà)地威脅着基于這些細胞而發表的論文的質量和研究發現的正确性。爲此,很多細胞庫現在都要對提交來的細胞系進行STR分(fēn)型檢測,并對細胞系之間的交叉污染進行監測。
細胞STR分(fēn)型檢測方法
基于毛細管電(diàn)泳檢測的STR分(fēn)型檢測使用的是多重PCR複合擴增系統,可以同時擴增19個STR位點加1個性别決定位點Amelogenin,每個被分(fēn)析的人源細胞系都有其獨特的DNA重複模式,因此通過與基礎圖譜進行比對,即可對每一(yī)批新細胞系的種類進行确認。
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