短串聯重複序列(short tandem repeat, STR)是核心序列爲2-6個堿基的短串聯重複結構。20世紀90年代初,STR基因座首次作爲一(yī)種重要的遺傳标記在人類親權鑒定中(zhōng)被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。
STR分(fēn)型檢測(short tandem repeat)是一(yī)種檢測技術。主要用于檢測人類及哺乳動物(wù)的基因組。
STR(short tandem repeat,短片段重複序列)廣泛存在于人類及哺乳動物(wù)的基因組中(zhōng),具有高度多态性,它們一(yī)般由2-6個堿基構成一(yī)個核心序列,核心序列串聯重複排列,由核心序列重複數目的變化産生(shēng)長度多态性。對于一(yī)個特定的個體(tǐ),染色體(tǐ)上某個特定位置的重複序列的重複次數是固定的,而對于不同的個體(tǐ)在同一(yī)位置處的重複次數可能不同,這就構成了人群中(zhōng)這些重複序列的多态性。由于人類基因組中(zhōng)這種重複序列非常多,通過對這種多态性的檢測,就可以明确區分(fēn)個體(tǐ)與個體(tǐ)的不同,确定父母子的親緣關系。
由于STR技術的高靈敏度、自動化程度高、準确快速、重複性好等優點,STR基因分(fēn)型已被作爲金标準應用于細胞鑒定,由于細胞系交叉污染或錯誤辨識而導緻研究錯誤、結果不可重複等情況的存在,因此建議在實驗開(kāi)展前進行細胞的STR鑒定分(fēn)析。
細胞STR鑒定即通過STR信息建立細胞系的遺傳特性,通過STR鑒定來檢測細胞是否發生(shēng)交叉污染或者誤認的情況。STR 基因座位上的等位基因可通過擴增區域内重複序列拷貝數的不同來區分(fēn),在毛細管電(diàn)泳分(fēn)離(lí)之後可通過熒光檢測來識别。随後通過一(yī)定的計算方法,即可根據所得的STR分(fēn)型結果與細胞STR數據庫比對,從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。